In 2004 bracht Apple de iPod mini uit die net een slag kleiner was dan zijn voorgangers. De mini had een 4 GB harde schijf en
was verkrijgbaar in 5 pastelkleuren. Ondanks de hoge prijs werd de mini toch een succes.
Nogmaals werd de bediening aangepast: het scrollwiel werd vervangen door
een 'click-wheel'. De toetsen waren vervangen en werden in de 'click-wheel' geplaatst.
In 2005 kwam er nog een versie uit van de iPod mini.
Er was nu een keuze mogelijk uit 6 verschillende kleuren en ook meer opslagruimte, 4 GB of 6 GB. De batterij van de mini gaat nu ongeveer 18 uur mee, een groot verschil met de allereerste iPod.
In september 2005 is de productie van de mini stopgezet . De mini is vervangen door de iPod nano.